Problemas al descargar registros

Nosotros tenemos 9 dispositivos de fichaje en las diferentes sucursales y a la hora de descargar nuevos registros nos faltan registros, En su momento lo planteamos y nos sugirieron descargar todos los registros, el problema con eso es que al descargar todos los registros se vuelve para atrás todo el trabajo que se haya hecho (cambiar IN x OUT o agregar fichadas que los chicos olvidaron realizar)
Para solucionar esto se los instalo en 2 PC una en la que se realizan las modificaciones y otra en la que se descargan todos los registros.
Hace un tiempo se rompió uno de los dispositivos y contratamos una hora de servicios técnicos para instalar el nuevo dispositivo y luego de que se instalo este problema se agravo siendo que ahora nos faltan días completos de registros, no se si existe alguna solución para este inconveniente por que realmente es un trabajo muy engorroso